تحتوي الأكاديمية على خمسة مختبرات علمية مجهزة تجهيزاً تقنياً علمياً عالي الجودة.

مختبران  للكيمياء والأحياء، ومختبران  للفيزياء، و مختبر خاص بطلاب الحلقة الأولى والروضة.

جميع المختبرات حديثة مجهزة بكل الأدوات اللازمة لرفد الخبرات العملية لجميع المراحل التعليمية.