يتوفر في الأكاديمية مسبحان مغلقان؛ أحدهما للبنين والآخر للإناث مجّهزان بكافة معايير السلامة وبكل المستلزمات الرياضية الضرورية. وللمسابح تعليمات وإرشادات وأوقات ينظمها المعلم المسؤول حسب جدول زمني معتمد من إدارة الأكاديمية،  يكون المسبح مغلقاً إغلاقاً تاماً في غير حصص السباحة، ومفتاحه فقط مع مسؤول المسبح ورئيس قسم الرياضة.